近日,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室暨湖北洪山实验室谢卡斌教授课题组,在《分子植物》揭橥的研究论文,宣布了一种大规模、高通量编辑植物基因的方法,并利用该方法编辑了水稻中全部受体激酶基因,为快速鉴定抗病、抗逆干系的基因供应了新资源。

基因编辑流程得以高效优化

基因编辑技能在生命科学根本研究和作物遗传改良方面蕴含巨大潜力,因此成为近几年生命科学领域的研究热点和科研竞争制高点。
作为一种将生物DNA序列进行精准修正的技能,CRISPR/Cas9自2013年被用于基因编辑以来,一贯处于火速发展中。

伴随CRISPR/Cas9基因编辑技能在植物研究中日益成熟,利用CRISPR文库进行高通量的遗传筛选成为可能。
目前有两种CRISPR文库构建策略,即稠浊型文库和阵列式文库。
个中,稠浊型CRISPR文库已被多个实验室用于水稻、玉米、番茄等作物突变体库的构建,但尚未有阵列式CRISPR文库在植物中运用的宣布。

基因编辑流水线助力作物病害防控

植物CRISPR/Cas9基因编辑技能在农业领域运用越来越广泛。
水稻等作物编码了数万个基因,仅几千个基因的功能得到研究。
如何利用CRISPR/Cas9基因编辑技能快速分离和鉴定调控主要农艺性状的基因,是植物基因编辑技能领域的一个主要课题。

谢卡斌是最早开展植物CRISPR/Cas9基因编辑工具研发的科研职员之一,他所在的课题组在该领域积累了多项新技能成果。

在前期工具根本上,谢卡斌课题组创建了靶向敲除1072个水稻类受体激酶的基因编辑材料,为快速鉴定抗病、抗逆干系基因供应了新资源。
他们还开拓出一套名为“FLASH”的基因编辑“流水线”,高效优化了全体基因编辑流程,可以通过常规聚合酶链式反应(PCR)和凝胶电泳读取每个载体和转化植株的靶基因信息。

谢卡斌先容,该“流水线”包含设计编辑位点打算机程序、高效率CRISPR/Cas9基因编辑载体、高通量构建基因编辑载体克隆方法等。
“更主要的是,我们在‘流水线’中设计了一种新方法,向基因编辑载体中引入了不同长度的DNA序列作为标签,用来快速鉴别基因编辑材料的‘身份’。
”他说。

“地毯式”搜索农作物中特定基因

谢卡斌说,载入标签后,通过大略PCR就可快速、实时地读取CRISPR/Cas9载体、基因编辑植物质料的信息。
利用该基因编辑“流水线”,可以迅速地构建包含数十乃至上万个基因材料信息的基因编辑文库。

得益于基因编辑文库,研究职员可以对所有基因的功能进行“地毯式”搜索,找出个中与抗病、抗逆、产量等主要农艺性状干系的基因。

开拓了高通量基因编辑“流水线”,谢卡斌课题组便将此技能用于水稻抗病研究。
植物病害一贯是农业生产重大威胁之一,利用当代生物技能来提高作物抗病能力是应对作物病害的关键手段。

课题组在试验中创造,一类被称为受体激酶的基因,是植物识别病原物必不可少的组分。
利用FLASH基因编辑“流水线”,课题组博士研究生陈凯园在一年旁边韶光内完成了所有1000余个水稻类受体激酶的基因编辑,目标基因的编辑效率在90%以上。

对受体激酶干系基因展开初步测试后,谢卡斌课题组选择了15个基因材料进行稻瘟病接种试验,鉴定到了9个抗稻瘟病干系基因。
对受体激酶基因的编辑仅仅是一个开始,他们希望利用所构建的高通量基因编辑“流水线”,对水稻等紧张农作物基因开展“地毯式”功能搜索,为作物遗传改良供应理论和技能支持。

谢卡斌表示,基因编辑是CRISPR/Cas9系统最主要的一个运用。
除了基因编辑,CRISPR/Cas9系统还可改造身分歧工具用于农业生产。

谢卡斌认为,这些CRISPR/Cas系统改造而来的工具会大大加速我们对作物病害的根本研究,也会带来用于作物病害绿色防控的新技能新方法。
( 吴纯新 通讯员 蒋朝常)

来源: 科技日报