编辑 | 谢欣
11月11日，颜宁在微博回应近期返国创办深圳医学院科学院，及其核心科研方向正被AI代替等干系话题。她表示，AI是基于其此前的研究解析数据根本上对人体蛋白质构造进行预测，期待AI越来越强大帮助生物科研事情者可以正儿八经地从化学角度研究生命起源。
颜宁还表示，充足的启动经费是科研职员在科学自由探索的根本，“第一惨是想做实验没经费；第二惨则是大把启动经费才用一半就招招手要走了。”
此外，颜宁还是回应称：
但是这两天有发自内心爱护我的师友总喊我辟谣，我真的很忙啊（忙到现在才瞜一眼微博，随意马虎么我）。八竿子打不着、错漏百出、但凡花一个钟头读论文也不至于那么眼瞎的碰瓷文章，给眼神都摧残浪费蹂躏韶光，为啥要我辟谣啊？有朋友想写澄清文章也被我拦了，美意心领了，但真犯不着（当然，如果将来某天SMART的法务看不下去了有什么行动，我就不拦了，反正现在小伙伴们已经默默地该截屏截屏，该存档存档--感激目前在厦门那位，从你那受的启示[坏笑]祝好运[打call]）
【无缝切换到科普博主】去年8月8日，给了一个报告，谈论了AlphaFold的局限性；到今年的11月11日，创造去年的报告还是可以一张都不用改。简而言之，我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题（electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins），AlphaFold在我们过去解析的诸多构造的根本上，去年的预测达到了我们2017年的水平；今年依旧勾留在我们2017年的水平（这里仅针对Nav/Cav）。在与专门做构造预测的AI团队互助，他们做预测我们做实验，测试新型小分子与蛋白的相互浸染，迄今为止预测无一精确。
构造生物学不仅仅是看到Fold（折叠），更要理解蛋白质的动态变革，要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互浸染，要理解在细胞原位里的状态，这些都是AI目前尚无能为力的领域，由于尚没有足够的数据库去演习它。举个例子，我们Cav2.2的构造去年揭橥晚了，尚未放在数据库里被AlphaFold用来演习，以是它预测的模型就与实验构造严重不符。
真正的研究者都乐于拥抱技能进步，善用各种技能去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上，我期待AI越来越强大，如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现 网页链接，那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。
【规复傲娇毒舌本色】之前跟一个密友逗贫：做PI(principal investigator) 第一惨是想做实验没经费；第二惨则是大把启动经费才用一半就招招手要走了，不带走一叨乐。准备做PI的孩子们，记住在求职的时候，启动经费越多越好，由于那是你做科研最自由的fund。啥叫endowed chair （讲席教授）啊？这不但是个名誉头衔，背后那是真金白银捐赠来的让你自由探索的经费，有这种不用写proposal的unrestricted fund，多想不开才非要申请NIH的啊（当然，还是要申请一两个嘛，否则我替闲人说：你看，申请不到吧）
此前在2022深圳环球创新人才论坛上，颜宁宣告，即将辞去普林斯顿大学教职，归国加盟深圳医学科学院。早在2017年，因选择离开任教10年的清华大学到普林斯顿大学就职，颜宁曾遭受不少争议。如今颜宁毫无征兆的宣告选择归国，再次引发网络热议，包括其紧张研究方向是否已被人工智能代替等。
构造生物学是生物物理学的一个主要分支。该学科紧张运用物理学的思想与研究办法，采取X射线晶体衍射、核磁共振、冷冻电镜成像等技能，精确解析蛋白质、核酸等生物大分子的三维构造及生物大分子之间的相互浸染机制。研究这类问题的群体被称为构造生物科研事情者。颜宁便是个中的一员。她的紧张研究领域为主要膜蛋白的构造与功能机理。
简而言之，许多像颜宁一样的构造生物学科研事情者，他们的日常事情便是帮助人类看清楚这些上述提及的构成生命活动根本的大分子以及它们那更加眇小和繁芜的空间构造。诺贝尔奖得到者费曼曾经半开玩笑地说，“许多根本的生物问题是非常随意马虎办理的——只要能看到它们就行。”
近年来，随着英国的人工智能公司DeepMind发布的AlphaFold2，以原子水平的准确度预测了2/3的蛋白质构造，让非机构生物学专业的"大众年夜众以为AI技能已能代替构造生物学科研事情者的事情。在知乎上，乃至还有人将AI技能AlphaFold2比喻为珍妮纺织机，而把构造科研事情者进行的构造生物学实验则喻为手事情坊。
颜宁表示，其专注于电压门控钠离子和钙离子通道几个关键问题（electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins）。AlphaFold在其团队过去解析的诸多构造的根本上，去年的预测达到了其团队2017年的水平；今年依旧勾留在其团队2017年的水平（这里仅针对Nav/Cav）。在与专门做构造预测的AI团队互助，他们做预测其团队做实验，测试新型小分子与蛋白的相互浸染，迄今为止预测无一精确。
想理解颜宁回应文案的意思，便得首先得理解其所说的其专注的科研项目——电压门控离子通道是什么？电压门控离子通道是一大类位于细胞膜上、通过感想熏染电旗子暗记掌握离子跨膜进出细胞的蛋白质。
上世纪四五十年代，英国科学家霍奇金和赫胥黎创造了动作电位。之后，他们创造电压门控钠离子通道引发动作电位，而电压门控钾离子通道（Kv通道）则能使细胞去极化，规复至静息电位。
电压门控离子通道目前是仅次于G蛋白偶联受体（GPCR）的第二大药物靶点。外科手术用到的镇痛剂通过抑制钠离子通道（Nav通道）起浸染；钙离子通道（Cav通道）则是降压药物的靶点。因此，对付电压门控离子通道的研究尤其是构造生物学研究具有主要的生理学和药理学意义。
而钙离子（Ca2+）是生物体内主要的第二信使，在肌肉紧缩、神经旗子暗记通报、腺体分泌、基因转录调控以及细胞凋亡等浩瀚生命过程中扮演主要角色。一样平常情形下，细胞内的钙离子浓度远低于细胞外或者内质网中的钙库。
五十年代，科学家创造在没有钠离子的情形下，依赖钙离子也能产生动作电位，这是由电压门控钙离子通道介导的生理过程。电压门控钙离子通道相应细胞膜电位变革而激活，运输钙离子进入细胞，进而引发一系列下贱旗子暗记通路。
个中，Cav1.1（也叫dihydropyridine receptor，DHPR）是最早被鉴定出的电压门控钙离子通道，紧张位于骨骼肌细胞的横小管（transverse tubule），是肌肉愉快紧缩偶联（excitation-contraction（E-C）coupling）过程中的关键蛋白。骨骼肌细胞在愉快旗子暗记浸染下会导致膜电位的变革，Cav1.1在感想熏染膜电位变革后与肌质网膜上的RyR1蛋白发生相互浸染，导致RyR1将肌质网中的钙离子快速大量开释到肌细胞质中，进而引起骨骼肌紧缩。
据清华大学新闻网此前，2015年12月22日，颜宁在担当清华大学教授期间，其研究组在《自然》（Nature）杂志揭橥题为《电压门控钙离子通道复合物Cav1.1的三维构造》（Structure of the voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex）的研究论文，首次宣布了真核生物电压门控钙离子通道的4.2埃分辨率的冷冻电镜构造，为理解其功能供应了主要的线索。
在此之前，虽然创造钙（钠）离子通道原核同源蛋白晶体构造，但它们的通道亚基是由四条相同的肽链组成的同源四聚体，并且没有赞助性亚基。因此为了更好地理解真核电压门控钙离子通道的构造与功能，诸多科研事情者一贯致力于解析真核钙离子或钠离子通道的构造，但由于技能难度，此前只有低分辨（~20埃）的电镜构造。
根据上述颜宁2015年刊发的论文，其已经解析了肌肉愉快紧缩通路上的膜蛋白，包括电压门控钠离子通道（细菌同源蛋白NavRh）、电压门控钙离子通道、以及最大的钙离子通道RyR1的构造，从而为理解这一基本生理过程的分子机理打下主要根本。
据清华大学新闻网，2016年9月1日，颜宁研究组又刊发《电压门控钙离子Cav1.1通道3.6埃分辨率构造》（Structure of the voltage-gated calcium channel Cav1.1 at 3.6 angstrom resolution）的研究长文（Research Article），宣布了首个真核电压门控钙离子通道的近原子分辨率三维构造。
该研究宣布的3.6埃电镜构造比较前述的4.2埃只管在数字上看似进步不大，却有着质的飞越。在该构造中，大部分氨基酸的侧链能够被清晰分辨，从而可以据此搭建出准确和完全的构造模型。新的构造揭示了大量新信息，更新了科研事情者对电压门控钙离子通道的认识，
根据颜宁2016年刊发的论文，颜宁研究组已经成功解析了肌肉愉快-紧缩偶联通路上的两个关键膜蛋白Cav1.1以及RyR1的构造，从而为理解这一基本生理过程的分子机理打下主要的构造根本。也可以说，颜宁的科研成果为理解为数浩瀚的具有主要生理和病理功能的电压门控钙离子和钠离子通道的事情机理奠定了根本。
实际上，构造生物学科研事情者的终极目标并不是将一个有一个蛋白构造不雅观察出来，而是寻出自然规律利用氨基酸序列直接预测蛋白空间构象，而以AlphaFold2为代表的AI技能正是与前述两种实验手段相辅相成。
颜宁表示，构造生物学不仅仅是看到折叠（Fold），更要理解蛋白质的动态变革，要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互浸染，要理解在细胞原位里的状态，这些都是AI目前尚无能为力的领域，由于尚没有足够的数据库去演习它。举个例子，其团队Cav2.2的构造去年揭橥晚了，尚未放在数据库里被AlphaFold用来演习，以是它预测的模型就与实验构造严重不符。
一位生物医药人士曾向界面新闻表示，以AlphaFold2为代表的的AI蛋白构造预测算法，还没法取代构造生物学的湿实验。AI技能的确预测来险些所有Uniprot（蛋白质序列与功能信息数据库）中的序列的构造，但这些预测模型的质量仍良莠不齐。
湿实验指的是在实验室里采取分子、细胞、生理学试验方法进行研究，也便是传统的药物研发实验室；而干实验则是通过打算机仿照及生物信息学方法来进行研究，也便是AI平台做的事情。
另一位生物医药人士也向界面新闻表示，AI只能是补充手段，可以减少确定构造过程中的很多麻烦，但终极仍分开不开科研职员的实验验证。“纵然你基于当前模型，预测的准确率达100%，也不能在不进行湿实验的情形下确定该构造的准确性。”