他们利用深度学习神经网络,加速分子聚拢体引发态动力学的打算仿照过程,与传统基于量子力学打算的非绝热动力学方法比较,速率最高可提升 130 万倍。

并且,实现了精准预测聚拢勾引发光(AIE,Aggregation-induced emission)分子的荧光增强系数,与实验结果同等。

在此根本上,该方法供应了准确丰富的引发态分子构造信息,在原子分辨级别上揭示了分子聚拢体通过限定分子内振动,抑制非辐射跃迁并引发 AIE 征象的机制。

该研究通过剖析引发态分子构造蜕变,展示了对 AIE 征象的直不雅观认识,加深了对传统 AIE 机制的理解,为未来更理性地设计 AIE 材料供应更充分的依据和辅导。

科学家开拓AI光动力学模拟方法揭示聚集引导发光现象机制

图丨李竞白(来源:李竞白)

“该方法能一定程度避免 AIE 分子设计与合成方面的反复试错,从而向 AIE 材料的理性设计迈进一步。
”李竞白表示。

从更长远来看,随着理论化学与 AI for Science 的结合,有望通过展示打算化学领域的发展,进一步扩大理论与打算化学的影响力,进而创造更多理论实验相结合的新型研究范式。

与量子力学打算比较,速率提升 130 万倍

AIE 是一种光物理征象,其过程由弱光发光的有机发色团聚拢成强发光。
2001 年,喷鼻香港科技大学唐本忠院士第一次创造,并提出 AIE 的观点,为发光材料的研究和运用开辟了新的方向。

AIE 材料在诸多领域表现出运用潜力,例如,光电器件、医学诊疗、化学传感、智能相应等。
2016 年,AIE 材料纳米聚拢体与其他三种纳米材料,共同被 Nature 认定为“纳米光革命”的材料 [2]。

该研究的起源要从 2022 年提及,彼时,李竞白刚返国任教。
在他理解海内科研进展,与学生们谈论到 AIE 征象时,认为这是值得研究的、故意思的问题之一。
此后,李竞白便开始进行该方向的文献调研。

他创造,虽然海内近年来在 AIE 方面已经有很多干系宣布,但在脑海里始终有一个问题挥之不去:AIE 的实质到底是什么?

由于此前大部分的文献宣布都是从实验角度出发,以在聚拢体中减少的非辐射衰减作为 AIE 的阐明。

基于理论化学的科研背景,李竞白始终认为个中有一些无法“自洽”的地方,为了“冲破砂锅问到底”,他与团队开始了这项独立研究后的首个课题。

图丨AIE 机理示意图(来源:Chem)

然而,不可忽略的是,打算方面始终存在难度大和本钱高的问题。

一方面,在韶光分辨实验中,缺少引发态分子的构造信息;另一方面,理论仿照面临着目标分子体系大、仿照韶光长等寻衅,导致基于传统量子力学打算的非绝热动力学方法的本钱过于昂贵。

受国外团队通过引入机器学习、神经网络,来办理打算化学中的打算本钱问题的启示,李竞白带领课题组研发了这项研究中的主要工具——机器学习光动力学仿照软件,名称为 PyRAI2MD(Python Rapid Artificial Intelligence Ab Initio Molecular Dynamics),以打破现有理论化学打算方法的瓶颈。

该研究结合了多种技能手段,包括量子化学打算、深度神经网络、半履历方法、分子力学方法和非绝热动力学方法。

基于此,研究了一系列经典 AIE 分子的引发态动力学,例如,六苯基噻咯(HPS,hexaphenylsilole)、四苯基噻咯(TPS,tetraphenylsilole)以及环辛四噻吩(COTh,cyclooctatetrathiophene)。

通过剖析仿照中不雅观测到的非辐射跃迁构造特色,研究职员创造,AIE 分子共轭环上碳-碳双键的旋转运动在聚拢状态下受到限定,从而抑制了其非辐射衰减跃迁。

图丨 AIE 征象的分子机制研究进展(来源:Chem)

为揭示 HPS、TPS、COTh 这三个分子的非辐射跃迁机制,研究职员对气态动力学轨迹以及聚拢体动力学轨迹进行仿照。
值得关注的是,该团队用新方法仿照打算所得的荧光量 AIE 系数,在实验值重现上得到打破。

详细来说,实验值方面,HPS、TPS 和 COTh 的 AIE 系数分别为 255、3 和 12;而本次研究中,三个分子的 AIE 系数对应分别为 263、5 和 12。

李竞白表示,该仿照效果与实验数据高度吻合,这也很好地验证了机器学习光动力学方法的可靠性。

值得关注的是,这种新的打算方法保持速率快的同时,也担保了打算方法的精确度。

相较于常规的含时密度泛函理论(‌TDDFT,Time-dependent Density Functional Theory)打算,该方法速率最快能提升 130 万倍,同时打算精度还能保持在 1 千卡/摩尔,这也是能实现如此繁芜仿照的关键之一。

构造蜕变对揭示剖析分子引发态动力学机理非常主要。
虽然在实验中得到分子构造与性能的构效关系相对随意马虎,然而,测得分子构造随韶光蜕变的信息却并非易事。

李竞白表示:“我们通过这种高效、高精度的打算仿照,为研究引发态动力学中的分子构造蜕变,供应了非常直不雅观的研究方法。
在此根本上,结合我们的实验征象,终极实现了定量研究构效关系的目标。

此外,该研究在仿照尺寸方面也实现了打破,其所关注的不再是单一的分子体系,而是聚拢体状态下的动力学过程。

在以往的研究中,引发态打算分子动力学的打算量大部分在 100 个原子以内,而该研究处理的体系最多达 1917 个原子,进一步拓展了 AIE 理论方法和处理体系的尺度。

用一年韶光回答审稿人的“灵魂拷问”

李竞白具有交叉学科的科研背景,他本科毕业于郑州大学,在美国伊利诺伊理工大学化学系获博士学位,聚焦于理论打算方向。

之后,在美国东北大学化学与生归天学系史蒂文·洛佩斯(Steven Lopez)教授课题组从事博士后研究事情,并从那时起开始打仗分子动力学、引发态性子的打算力学等前沿的课题。

目前,担当深圳职业技能大学霍夫曼前辈材料研究院副教授,紧张研究方向为高能量密度有机材料设计,光化学反应理论仿照,以及机器学习非绝热动力学方法开拓。

该研究经历约一年半的韶光,是李竞白独立成立课题组以来的首个课题。

该研究涉及到基于传统量子力学的量子化学打算,因此须要研究职员对反应体系的电子构造性子有一些初步的理解。
在具备化学知识后,再将其转化成机器学习的形式。

该论文的投稿之路并不顺利,先后遭到了 Journal of the American Chemical Society Nature Chemistry 审稿人的质疑和期刊拒稿。

在前期投稿时,审稿人提出,该仿照方法对付引发态动力学的速率具有明显的高估。

基于此,李竞白与学生一起检讨代码,并与干系的文献宣布进行比对,对仿照方法中的每一处细节都进行了反复的调试和改进。
“得到比较空想的结果后,我们团队都比较激动。
”他说。

另一位审稿人则对模型机理的可靠性和普适性再次发出“灵魂拷问”:这种方法是不是只适用于研究中的某个分子体系?是否可以真正地为 AIE 征象供应具有普适性、适用于多种不同分子类型的材料的理论支持呢?

为理解答这个问题,李竞白和团队足足用了一年韶光进行准备,以踏实完善的研究成果打动了 Chem 的编辑和审稿人。
回顾审稿的过程,李竞白说:“我们沉下心来,将原来研究的体系扩大,一步步打磨,终极给出了审稿人满意的答案。

Chem 的审稿人之一认为,仿照数据与实验数据同等,从仿照中得到的细节许可真实的分子理解 AIE 的过程。

另一位审稿人则评价称:“这篇手稿为非辐射衰变机制供应了可能。
这些结果是有趣的,并有望引起发光材料和光物理领域研究职员的兴趣。

终极,干系论文以《机器学习光动力学揭示在聚拢勾引发光中被阻断的非辐射机制》(Machine learning photodynamics uncover blocked non-radiative mechanisms in aggregation-induced emission)为题,揭橥在 Chem[1]。

深圳职业技能大学博士生王犁是第一作者,李竞白副教授和美国东北大学史蒂文·洛佩斯(Steven Lopez)教授担当共同通讯作者。

图丨干系论文(来源:Chem)

虽然该方法具有一定前辈性,但目前,机器学习神经网络模型演习仍旧存在寻衅。
该课题组希望不才个阶段的研究中,能够降落技能繁芜度和操作门槛,从而让更多研究职员更随意马虎地理解和利用该方法。

另一方面,基于神经网络利用的繁芜度,其精确度还有一定的提升空间。

据理解,当下国皮毛干团队在进行一些新的考试测验,例如新型神经网络构造、卷积神经网络以及最新比较热门的扩散模型等,但这类繁芜神经网络模型的问题在于,干系演习本钱比较高。

“我们希望可以在保持神经网络框架上风的同时,也能够将它的演习本钱掌握在一定范围内,从而扩大其运用领域。
”李竞白说。

图丨气相和分子聚拢体模型(来源:Chem)

此外,该研究在演习数据的采集过程方面也有一定优化空间,对付仿照新材料、新分子构造来说,除了神经网络架构的寻衅,还须要进行神经网络数据演习。

他阐明说道:“现有的一些方法虽然实现了部分自动化的数据采集,但是它离空想中的智能、便携、高效的演习方法还有一定间隔,这也是我们未来努力的方向。

AI for Science 为目前的科学问题带来新的不雅观点。
该研究中的理论打算光化学与机器学习的结合,正是 AI for Science 范式下催生的新领域。

以理论化学和打算化学领域为例,李竞白表示:“虽然当前量子化学打算方法在向更精确更高效发展,但打算机硬件对打算效率的制约仍不可忽略,而与 AI 结合的方法为打破打算性能供应了新的机会。

未来,他希望开拓出性能更好、本钱更低、架构更大略的神经网络模型,让更多学者共同参与到该领域的研究中。

参考资料:

1.Machine learning photodynamics uncover blocked non-radiative mechanisms in aggregation-induced emission.Chem(2024).https://doi.org/10.1016/j.chempr.2024.04.017

2.Lim, X. The nanolight revolution is coming. Nature 531, 26–28 (2016). https://doi.org/10.1038/531026a

3.https://github.com/mlcclab/PyRAI2MD-hiam

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