“不用最昂贵的镜头,也能拍出高清照片”,近年来,面对人们快速增长的影像清晰度需求,浩瀚手机、数码相机厂商不断探索如何在掌握本钱的情形下,利用AI模型进一步提升像素级。
这一次,同样的技能理念,却被复旦大学打算机科学技能学院教授颜波带领的团队迁移到了生命科学实验室里的常用研究工具“荧光显微镜”上。

4月12日,科学期刊《自然-方法》(Nature Methods)以《基于广义荧光显微镜的图像规复的预演习根本模型》(Pre-training a Foundation Model for Generalizable Fluorescence Microscopy-Based Image Restoration)为题刊发团队成果,他们发明的跨任务、多维度图像增强根本AI模型(UniFMIR),实现了对现有荧光显微成像极限的打破。

作甚荧光显微镜?这类显微镜利用部分物质受紫外线照射后可发荧光的特性,以及通过染色让本不具有该特性的物质发出荧光,可以不雅观察细胞内物质的接管、运输、化学物质的分布及定位等。
在分辨率方面,它远超普通光学显微镜0.2微米极限,到达不雅观测分子的纳米尺度,是生命科学领域不可或缺的研究工具。
自2006年横空出世,荧光显微镜已帮助环球科学家研制出了对帕金森氏症、阿尔茨海默氏症和亨廷顿氏症等神经退行性疾病更有针对性的治疗方法。

只管荧光显微镜的不雅观测分辨率已达到纳米尺度,但科学家们并不知足于此。
由于显微镜光学硬件和生物样本光敏感性(在荧光照射下,生物活性降落)带来的寻衅,过去几年中,生命科学和打算机领域的科学家们开始携手探索用AI的路径来增强图像质量的办法。
然而,成像模式多样、降质类型繁芜、增强过程迥异等一系列问题,使得这一任务极具寻衅性,于是,大多数科学家选择“每次办理一个问题”,聚焦于研制针对单一需求的“专有”AI模型。

复旦团队AI4S造实验神器显微镜秒变高清相机

来自复旦大学的这支AI for Science团队则选择直击寻衅,以“一站式集成”为目标,直接构建了首个“统一”的荧光显微镜图像增强AI根本模型(UniFMIR),大幅提升在“图像超分辨率重构、各向同性重构、3D去噪、图像投影和过程重修”五大任务方向上的性能。

UniFMIR采取了基于Swin Transformer构造的特色增强模块来增强特色表示,针对不同任务的网络流程共享相同的特色增强打算。
通过网络的大规模数据集对模型进行预演习,并利用不同图像增强任务的数据微调模型参数,UniFMIR展现出比专有模型更好的增强性能和泛化性。

荧光显微镜图像增强根本模型(UniFMIR)架构

这意味着,加载了UniFMIR的荧光显微镜可能成为生命科学实验室中的“神器”。
科学家们能更清晰地不雅观察到活细胞内部的眇小构造和繁芜过程,加速环球生命科学、医学研究、疾病诊断干系领域的科学创造和医疗创新;同时,在半导系统编制造、新材料研发等领域,该成果可以用来提升不雅观察和剖析材料微不雅观构造的质量,从而优化制造工艺和提高产品质量。

UniFMIR的成功研发标志着我国在关键科学仪器领域“国产设备+根本模型”的组合能有效减少对入口设备的依赖,增强国家科技自主性和家当安全,也为环球科研领域的进步贡献了中国聪慧和力量。

“这次我们想到把AI图像增强技能运用于荧光显微镜上,并构建UniFMIR,出发点便是AI for Science。
我们的模型为荧光显微镜图像增强供应了一个通用的办理方案,通过大略的参数微调便可运用于不同任务、成像模式和生物构造。
未来,生命科学实验室的科学家们可通过进一步扩展演习数据的数据量和丰富度来不断强化UniFMIR的图像重构能力。
”颜波对UniFMIR被用于更多类型实验的可能性充满信心。

复旦大学打算机科学技能学院数字媒体实验室成员

来源:上海杨浦